ZoteroのPDFをAIと精読する：Yomitomoとの手動ワークフロー

Zoteroで管理している論文PDFをYomitomoに手動で取り込み、原文に注釈を付けてAIと対話できます。文献情報と正式な引用はZoteroで管理し続けます。Zoteroアカウントの直接接続や、ハイライト・メモの自動同期はありません。

Yomitomoプロジェクトがv0.16.2の機能と設定に基づいてまとめたガイドです。

この組み合わせでできること

作業	使うツール	受け渡し方法
文献情報・引用の管理	Zotero	Zoteroのライブラリをそのまま利用
PDFの精読・注釈・AI対話	Yomitomo	ローカルのPDFファイルを手動で取り込み
読後のまとめ	Yomitomo	自分で文章を編集し、必要に応じてAIに確認を依頼
執筆用のメモと引用	Zoteroや執筆ツール	まとめの本文を手動でコピー。正式な引用は原本で確認

Zoteroだけで読書が完結している場合、すべての文献を移す必要はありません。段落ごとのAI対話を試したい論文を1本選んで始められます。

1. ZoteroからPDFファイルを用意する

対象文献のPDF添付ファイルを確認し、ローカルのファイルを用意します。クラウドにだけ存在する場合は先にダウンロードしてください。ここで渡すのはPDF原本です。Zotero内の注釈やメモがYomitomoの注釈に変換されるわけではありません。

Zotero側のPDFと注釈については公式のPDFリーダーガイドを参照してください。

2. Yomitomoへ取り込む

読書ライブラリの「+」からPDF文書の追加を選びます。対象ファイルを選択し、開いた文書で文章を選択できることを確認します。スキャンPDFは別途OCRが必要です。

PDF原本を手動で取り込みます。Zoteroとの自動同期画面ではありません。

取り込んだPDFはYomitomoのデータ領域にも保存されるため、元の保存場所とは別にディスク容量を使います。取り込みガイドで対応範囲を確認できます。

3. 論点ごとに読む

結論、実験条件、限界を述べた段落などを選び、A でハイライトとメモを作成します。対話欄の @ から読書助手を選び、次のような質問を試します。

• この結論が成立する条件は何か。
• 比較実験で固定されている変数は何か。
• 著者が明示した限界と、自分が推測した限界を分けられるか。

AIには設定したモデルを使います。リモートモデルなら関連する本文や対話が接続先へ送られます。設定方法はモデルとデータのガイドを参照してください。

4. 読後のメモをZoteroに戻す

読後に「主張・根拠・限界・自分の疑問」を自分の言葉でまとめます。本文をコピーし、Zoteroの該当文献のメモや執筆用ファイルへ貼り付けます。文献タイトルとページ番号も原本で確認してください。

コピーされるのは選択した文章です。Yomitomoの原文アンカー、注釈の位置、対話履歴は自動では移りません。引用情報や参考文献リストの生成は引き続きZotero側で行います。

試してから使い分ける

Yomitomoをダウンロードして、論文1本で試す。基本操作はPDF注釈ガイドにまとめています。